ROBERTO SERRA OSPITE CON ACCESSO AL SERVIZIO VPN presso: Dipartimento di Scienze Fisiche, Informatiche e Matematiche sede ex-Fisica |

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## Pubblicazioni

**2021**
- A Fast and Effective Method to Identify Relevant Sets of Variables in Complex Systems
[Articolo su rivista]

D’Addese, Gianluca; Casari, Martina; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2021**
- Asymptotic Information-Theoretic Detection of Dynamical Organization in Complex Systems
[Articolo su rivista]

D'Addese, Gianluca; Sani, Laura; La Rocca, Luca; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2021**
- Dynamical properties and path dependence in a gene-network model of cell differentiation
[Articolo su rivista]

Braccini, M.; Roli, A.; Villani, M.; Serra, R.

abstract

**2020**
- Avalanches of perturbations in modular gene regulatory networks
[Capitolo/Saggio]

Vezzani, A.; Villani, M.; Serra, R.

abstract

**2020**
- Evolving always‐critical networks
[Articolo su rivista]

Villani, M.; Magri, S.; Roli, A.; Serra, R.

abstract

**2020**
- Exploring the Dynamic Organization of Random and Evolved Boolean Networks
[Articolo su rivista]

d’Addese, Gianluca; Magrì, Salvatore; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2020**
- Selecting for positive responses to knock outs in boolean networks
[Capitolo/Saggio]

Villani, M.; Magri, S.; Roli, A.; Serra, R.

abstract

**2020**
- The effects of a simplified model of chromatin dynamics on attractors robustness in random boolean networks with self-loops: An experimental study
[Capitolo/Saggio]

Braccini, M.; Roli, A.; Villani, M.; Montagna, S.; Serra, R.

abstract

**2019**
- A View of Criticality in the Ising Model Through the Relevance Index
[Capitolo/Saggio]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2019**
- A simplified model of chromatin dynamics drives differentiation process in Boolean models of GRN
[Relazione in Atti di Convegno]

Braccini, Michele; Roli, Andrea; Villani, Marco; Montagna, Sara; Serra, Roberto

abstract

**2019**
- An improved relevance index method to search important structures in complex systems
[Relazione in Atti di Convegno]

Sani, L.; Bononi, A.; Pecori, R.; Amoretti, M.; Mordonini, M.; Roli, A.; Villani, M.; Cagnoni, S.; Serra, R.

abstract

**2019**
- Evolving critical boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Magri, S.; Villani, M.; Roli, A.; Serra, R.

abstract

**2019**
- Sustainable growth and synchronization in protocell models
[Articolo su rivista]

Serra, R.; Villani, M.

abstract

**2018**
- A comparison between threshold ergodic sets and stochastic simulation of boolean networks for modelling cell differentiation
[Relazione in Atti di Convegno]

Braccini, Michele; Roli, Andrea; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2018**
- A relevance index method to infer global properties of biological networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Sani, Laura; Amoretti, Michele; Vicari, Emilio; Pecori, Riccardo; Mordonini, Monica; Cagnoni, Stefano; Serra, Roberto

abstract

**2018**
- An iterative information-theoretic approach to the detection of structures in complex systems
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; Sani, Laura; Pecori, Riccardo; Amoretti, Michele; Roli, Andrea; Mordonini, Monica; Serra, Roberto; Cagnoni, Stefano

abstract

**2018**
- Dynamical Criticality in Gene Regulatory Networks
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; La Rocca, Luca; Kauffman, Stuart Alan; Serra, Roberto

abstract

**2018**
- Dynamical criticality: overview and open questions
[Articolo su rivista]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto

abstract

**2018**
- Dynamical properties of a gene-protein model
[Relazione in Atti di Convegno]

Sapienza, Davide; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2018**
- Simulating populations of protocells with uneven division
[Relazione in Atti di Convegno]

Musa, Martina; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Automatic design of boolean networks for cell differentiation
[Relazione in Atti di Convegno]

Braccini, Michele; Roli, Andrea; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Dynamical regimes in non-ergodic random Boolean networks
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; Campioli, Davide; Damiani, Chiara; Roli, Andrea; Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- GPU-based parallel search of relevant variable sets in complex systems
[Relazione in Atti di Convegno]

Vicari, Emilio; Amoretti, Michele; Sani, Laura; Mordonini, Monica; Pecori, Riccardo; Roli, Andrea; Villani, Marco; Cagnoni, Stefano; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Identifying Critical States through the Relevance Index
[Articolo su rivista]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Caprari, Riccardo; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Locating critical regions by the Relevance Index
[Relazione in Atti di Convegno]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Modelling Protocells
[Monografia/Trattato scientifico]

Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2017**
- New paths for the application of DCI in social sciences: Theoretical issues regarding an empirical analysis
[Relazione in Atti di Convegno]

Righi, Riccardo; Roli, Andrea; Russo, Margherita; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2017**
- Synchronization in near-membrane reaction models of protocells
[Relazione in Atti di Convegno]

Calvanese, Giordano; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- The use of omics-based approaches in regulatory toxicology: An alternative approach to assess the no observed transcriptional effect level
[Articolo su rivista]

Quercioli, Daniele; Roli, Andrea; Morandi, Elena; Perdichizzi, Stefania; Polacchini, Laura; Rotondo, Francesca; Vaccari, Monica; Villani, Marco; Serra, Roberto; Colacci, Annamaria

abstract

**2016**
- Beyond Networks: Search for Relevant Subsets in Complex Systems
[Capitolo/Saggio]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto

abstract

**2016**
- Dynamically critical systems and power-law distributions: Avalanches revisited
[Relazione in Atti di Convegno]

Di Stefano, Marina L.; Villani, Marco; La Rocca, Luca; Kauffman, Stuart A.; Serra, Roberto

abstract

**2016**
- Efficient search of relevant structures in complex systems
[Relazione in Atti di Convegno]

Sani, Laura; Amoretti, Michele; Vicari, Emilio; Mordonini, Monica; Pecori, Riccardo; Roli, Andrea; Villani, Marco; Cagnoni, Stefano; Serra, Roberto

abstract

**2016**
- On the dynamics of autocatalytic cycles in protocell models
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Filisetti, Alessandro; Nadini, Matthieu; Serra, Roberto

abstract

**2016**
- On the robustness of the detection of relevant sets in complex dynamical systems
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Carra, Pietro; Roli, Andrea; Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto

abstract

**2015**
- Dynamical Properties of Artificially Evolved Boolean Network Robots
[Relazione in Atti di Convegno]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Serra, Roberto; Benedettini, Stefano; Pinciroli, Carlo; Birattari, Mauro

abstract

**2015**
- Exploring the organisation of complex systems through the dynamical interactions among their relevant subsets
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, Alessandro; Villani, Marco; Roli, Andrea; Fiorucci, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2015**
- The Search for Candidate Relevant Subsets of Variables in Complex Systems
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; Roli, Andrea; Filisetti, Alessandro; Fiorucci, Marco; Serra, Roberto; Poli, Irene

abstract

**2014**
- A stochastic model of catalytic reaction networks in protocells
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Filisetti, Alessandro; Villani, Marco; Graudenzi, Alex; Damiani, Chiara; Panini, Tommaso

abstract

**2014**
- Attractors Perturbations in Biological Modelling: Avalanches and Cellular Differentiation
[Capitolo/Saggio]

Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2014**
- Automatic Design of Boolean Networks for Modelling Cell Differentiation
[Capitolo/Saggio]

Stefano, Benedettini; Andrea, Roli; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2014**
- Growth and division in a dynamic protocell model
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; Filisetti, Alessandro; Graudenzi, Alex; Damiani, Chiara; Carletti, Timoteo; Serra, Roberto

abstract

**2014**
- Identifying emergent dynamical structures in network models
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Stefano, Benedettini; Andrea, Roli; Lane, David Avra; Irene, Poli; Serra, Roberto

abstract

**2014**
- Investigating the Role of Network Topology and Dynamical Regimes on the Dynamics of a Cell Differentiation Model
[Relazione in Atti di Convegno]

Graudenzi, Alex; Damiani, Chiara; Paroni, Andrea; Filisetti, Alessandro; Villani, Marco; Serra, Roberto; Antoniotti, Marco

abstract

**2014**
- On RAF Sets and Autocatalytic Cycles in Random Reaction Networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, Alessandro; Villani, Marco; Damiani, Chiara; Graudenzi, Alex; Roli, Andrea; Hordijk, Wim; Serra, Roberto

abstract

**2014**
- On Some Properties of Information Theoretical Measures for the Study of Complex Systems
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, Alessandro; Villani, Marco; Roli, Andrea; Fiorucci, Marco; Poli, Irene; Serra, Roberto

abstract

**2013**
- A model of protocell based on the introduction of a semi-permeable membrane in a stochastic model of catalytic reaction networks
[Abstract in Rivista]

Serra, Roberto; Alessandro, Filisetti; Alex, Graudenzi; Chiara, Damiani; Villani, Marco

abstract

**2013**
- Dynamical regimes and learning properties of evolved Boolean networks
[Articolo su rivista]

Stefano, Benedettini; Villani, Marco; Andrea, Roli; Serra, Roberto; Mattia, Manfroni; Antonio, Gagliardi; Carlo, Pinciroli; Mauro, Birattari

abstract

**2013**
- Emergent properties of gene regulatory networks - models and data
[Capitolo/Saggio]

Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2013**
- Identification of Dynamical Structures in Artificial Brains: An Analysis of Boolean Network Controlled Robots
[Relazione in Atti di Convegno]

Andrea, Roli; Villani, Marco; Serra, Roberto; Lorenzo, Garattoni; Carlo, Pinciroli; Mauro, Birattari

abstract

**2013**
- Mechanism for the formation of density gradients through semipermeable membranes
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2013**
- On the dynamical properties of a model of cell differentiation
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2013**
- Recent developments in research on catalytic reaction networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Chiara, Damiani; Alessandro, Filisetti; Alex, Graudenzi; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2013**
- The detection of intermediate-level emergent structures and patterns
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; A., Filisetti; S., Benedettini; A., Roli; Lane, David Avra; Serra, Roberto

abstract

**2013**
- The role of backward reactions in a stochastic model of catalytic reaction networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Alessandro, Filisetti; Alex, Graudenzi; Chiara, Damiani; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2012**
- Noise-Induced Emergent Hierarchies in a CA Model
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Serra, Roberto; Stefano, Benedettini; Andrea, Roli; Lane, David Avra

abstract

**2011**
- A Dynamical Model of Cell Differentiation
[Relazione in Atti di Convegno]

VILLANI, Marco; A., Barbieri; SERRA, Roberto

abstract

**2011**
- A dynamical model of genetic networks for cell differentiation
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; Barbieri, Alessia; Serra, Roberto

abstract

**2011**
- A stochastic model of autocatalytic reaction networks
[Articolo su rivista]

Alessandro, Filisetti; Alex, Graudenzi; Serra, Roberto; Villani, Marco; Rudolf M., Füchslin; Norman, Packard; Stuart A., Kauffman; Irene, Poli

abstract

**2011**
- A stochastic model of the emergence of autocatalytic cycles
[Articolo su rivista]

Alessandro, Filisetti; Alex, Graudenzi; Serra, Roberto; Villani, Marco; Davide De, Lucrezia; Rudolf M., Füchslin; Stuart A., Kauffman; Norman, Packard; Irene, Poli

abstract

**2011**
- Analysis of attractor distances in random boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Roli, A.; Benedettini, S.; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2011**
- Cell differentiation in noisy random boolean networks.
[Relazione in Atti di Convegno]

Barbieri, A.; Villani, Marco; Serra, Roberto; Kauffman, S. A.; Colacci,

abstract

**2011**
- Cell-cell interaction and diversity of emergent behaviours
[Articolo su rivista]

Damiani, Chiara; Serra, Roberto; Villani, Marco; S. A., Kauffman; A., Colacci

abstract

**2011**
- Conditions for long lasting sustainable innovation in an agent-based model
[Relazione in Atti di Convegno]

Ansaloni, L.; Villani, Marco; Serra, Roberto; Lane, David Avra

abstract

**2011**
- Dynamical properties of a Boolean model of gene regulatory network with memory
[Articolo su rivista]

Graudenzi, G.; Serra, Roberto; Villani, Marco; Damiani, C.; Colacci, A.; Kauffman, S. A.

abstract

**2011**
- Dynamical stability in random Boolean Networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Davide, Campioli; Villani, Marco; Irene, Poli; Serra, Roberto

abstract

**2011**
- Robustness analysis of a model of gene regulatory network with memory
[Articolo su rivista]

Graudenzi, Alex; Serra, Roberto; Villani, Marco; Damiani, Chiara; A., Colacci; S. A., Kauffman

abstract

**2011**
- Stochastic Local Search to Automatically Design Boolean Networks with Maximally Distant Attractors
[Relazione in Atti di Convegno]

Stefano, Benedettini; Andrea, Roli; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2011**
- The influence of the residence time on the dynamics of catalytic reaction networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, A.; Serra, Roberto; Villani, Marco; Graudenzi, A.; Fuechslin, R.; Poli, I.

abstract

**2011**
- The role of energy in a stochastic model of the emergence of autocatalytic sets
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, A.; Graudenzi, A.; Serra, Roberto; Villani, Marco; De Lucrezia, D.; Poli, I.

abstract

**2010**
- A stochastic model of catalytic reaction networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, A.; Serra, Roberto; Villani, Marco; Fuechslin, R.; Packard, N.; Kauffman, S. A.; Poli, I.

abstract

**2010**
- Dynamical stability of autocatalytic sets
[Relazione in Atti di Convegno]

Fuechslin, R.; Filisetti, A.; Serra, Roberto; Villani, Marco; De Lucrezia, D.; Poli, I.

abstract

**2010**
- Information transfer among coupled Random Boolean Networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Chiara, Damiani; Stuart A., Kauffman; Serra, Roberto; Villani, Marco; Annamaria, Colacci

abstract

**2010**
- Noisy random boolean networks and cell differentiation
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Serra, Roberto; Barbieri, A.; Roli, A.; Kauffman, S. A.; Colacci, A.

abstract

**2010**
- Non-linear protocell models: synchronization and chaos
[Articolo su rivista]

Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto; T., Carletti; Villani, Marco; I., Poli

abstract

**2010**
- On the dynamics of random Boolean networks subject to noise: attractors, ergodic sets and cell types
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Barbieri, Alessia; S. A., Kauffman; A., Colacci

abstract

**2010**
- WIRN 2010 - SPECIAL SESSION on THE DYNAMICS OF BIOLOGICAL NETWORKS
[Esposizione]

Villani, Marco; Serra, Roberto; Carlo, Morabito

abstract

**2009**
- A new model of genetic network: the gene protein Boolean network
[Relazione in Atti di Convegno]

Graudenzi, Alex; Serra, Roberto

abstract

**2009**
- AI*IA 2009: Emergent Perspectives in Artificial Intelligence, XIth International Conference of the Italian Association for Artificial Intelligence
[Curatela]

Serra, Roberto; Cucchiara, Rita

abstract

**2009**
- Assessment of polychlorinated biphenyls: propspects for a global approach
[Articolo su rivista]

F., Rotondo; A., Colacci; P., Silingardi; M., Mascolo; E., Morandi; S., Perdichizzi; S., Grilli; Serra, Roberto; M., Vaccari

abstract

**2009**
- Continuous network models of gene expression in knock-out experiments: a preliminary study
[Relazione in Atti di Convegno]

A., Roli; F., Vernocchi; Serra, Roberto

abstract

**2009**
- Dynamical critical systems for information processing: a preliminary study
[Relazione in Atti di Convegno]

Ansaloni, Luca; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2009**
- Exaptive processes: an agent-based model
[Capitolo/Saggio]

VILLANI, Marco; Bonacini, Stefano; FERRARI, Davide; SERRA, Roberto

abstract

**2009**
- Extended notion of attractors in noisy random Boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Barbieri, Alessia; Villani, Marco; Serra, Roberto; S. A., Kauffman; A., Colacci

abstract

**2009**
- Genetic regulatory networks and neural networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Graudenzi, Alex; Villani, Marco

abstract

**2009**
- Investigating cell criticality
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Damiani, Chiara; Graudenzi, Alex; P., Ingrami; A., Colacci

abstract

**2009**
- L’influenza delle perturbazioni sul paesaggio degli attrattori di una rete booleana casuale
[Relazione in Atti di Convegno]

Barbieri, A.; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2009**
- Modelling Innovation
[Capitolo/Saggio]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Lane, David Avra

abstract

**2009**
- Non linear protocell models: Syncronisation and Chaos
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto; T., Carletti; Villani, Marco; I., Poli

abstract

**2009**
- On the fate of perturbations in critical random Boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Damiani, Chiara; Graudenzi, Alex; Villani, Marco; Serra, Roberto; A., Colacci; Stuart A., Kauffman

abstract

**2009**
- Quando un insieme di reazioni è autocatalitico
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, A.; Serra, Roberto; Villani, Marco; Carletti, T.; Füchslin, R. M.; Poli, I.

abstract

**2009**
- Separating internal and external fluctuation in distributed web-based services
[Relazione in Atti di Convegno]

Casolari, Sara; Villani, Marco; Colajanni, Michele; Serra, Roberto

abstract

**2009**
- Studi preliminari per una rete booleana capace di apprendere da esempi
[Relazione in Atti di Convegno]

Ansaloni, L.; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2009**
- Synchronization phenomena in non linear protocell model
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto; Carletti, T.; Villani, Marco; Poli, I.

abstract

**2009**
- The growth of populations of protocells
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; T., Carletti; I., Poli; Filisetti, Alessandro

abstract

**2009**
- The influence of noise on the dynamics of random boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Barbieri, Alessia; Villani, Marco; Serra, Roberto; S. A., Kauffman; A., Colacci

abstract

**2009**
- Timing of molecular processes in a synchronous Boolean model of genetic regulatory network
[Relazione in Atti di Convegno]

Graudenzi, Alex; Serra, Roberto; Villani, Marco; Damiani, Chiara; A., Colacci; Stuart A., Kauffman

abstract

**2009**
- XI conference of the Italian Association for Artificial Intelligence
[Esposizione]

Serra, Roberto

abstract

**2008**
- A CA MODEL OF SPONTANEOUS FORMATION OF CONCENTRATION GRADIENTS
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2008**
- A NEW MODEL OF GENETIC NETWORKS: THE GENE-PROTEIN NETWORK
[Relazione in Atti di Convegno]

Graudenzi, Alex; Serra, Roberto

abstract

**2008**
- ARTIFICIAL LIFE AND EVOLUTIONARY COMPUTATION
[Curatela]

Serra, Roberto; Villani, Marco; I., Poli

abstract

**2008**
- COMUNICAZIONE CELLULARE, LIVELLI E STRUTTURE ORDINATE
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Damiani, Chiara; Graudenzi, Alex; A., Colacci

abstract

**2008**
- Evolutionary experiments for self-assembling amphiphilic systems
[Articolo su rivista]

M., Forlin; I., Poli; D., DE MARCH; N., Packard; G., Gazzola; Serra, Roberto

abstract

**2008**
- GENE EXPRESSION TIME-SERIES ANALYSIS OF CAMPTHOTECIN EFFECTS IN U-87-MG AND DBTRG-05 GLIOBLASTOMA CELL LINES
[Articolo su rivista]

Morandi, Elena; Severini, Cinzia; Quercioli, Daniele; D'Ario, Giovanni; Perdichizzi, Stefania; Capri, Miriam; Farruggia, Giovanna; Grazia Mascolo, Maria; Horn, Wolfango; Vaccari, Monica; Serra, Roberto; Colacci, Annamaria; Silingardi, Paola

abstract

**2008**
- Global and local processes in a model of innovation
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Serra, Roberto; Ansaloni, Luca; Lane, David Avra

abstract

**2008**
- SUFFICIENT CONDITIONS FOR EMERGENT SYNCHRONIZATION IN PROTOCELL MODELS
[Articolo su rivista]

T., Carletti; Serra, Roberto; I., Poli; Villani, Marco; Filisetti, Alessandro

abstract

**2008**
- SYNCHRONIZATION PHENOMENA IN PROTOCELL MODELS
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto; T., Carletti; I., Poli; Villani, Marco

abstract

**2008**
- Synchronization phenomena in internal reaction models of protocells
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; T., Carletti; Filisetti, Alessandro; I., Poli

abstract

**2008**
- THE DIFFUSION OF PERTURBATIONS IN A MODEL OF COUPLED RANDOM BOOLEAN NETWORKS
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Damiani, Chiara; Graudenzi, Alex; A., Colacci

abstract

**2008**
- THE SIMULATION OF GENE KNOCK-OUT IN SCALE-FREE RANDOM BOOLEAN MODELS OF GENETIC NETWORKS
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Graudenzi, Alex; A., Colacci; S. A., Kauffman

abstract

**2008**
- WIVACE 2008Workshop Italiano di Vita Artificiale e Computazione Evolutiva
[Esposizione]

Serra, Roberto; I., Poli

abstract

**2007**
- An agent-based model of exaptive processes
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; S., Bonacini; Ferrari, Davide; Serra, Roberto; Lane, David Avra

abstract

**2007**
- Angiopoietin-2 expression in B-cell chronic lymphocytic leukemia: association with clinical outcome and immunoglobulin heavy-chain mutational status
[Articolo su rivista]

Maffei, Rossana; Marasca, Roberto; Martinelli, Silvia; Castelli, Ilaria; Santachiara, R; Morandi, E; Zucchini, Patrizia; Fontana, M; Giacobbi, F; Silingardi, P; Bonacorsi, G; Temperani, Paola; Masini, L; Colacci, Am; Serra, Roberto; Torelli, Giuseppe

abstract

**2007**
- Comunicazione cellulare, livelli e strutture ordinate.
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Damiani, C.; Graudenzi, A.; Colacci, A.

abstract

**2007**
- Conditions for emergent synchronization in protocells.
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Carletti, T.; Poli, I.; Villani, Marco; Filisetti, Alessandro

abstract

**2007**
- Interacting random boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Damiani, Chiara; Graudenzi, Alex; A., Colacci; S. A., Kauffamn

abstract

**2007**
- Modelli di protocellule e sincronizzazione
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Carletti, T.; Poli, I.; Villani, Marco; Filisetti, A.

abstract

**2007**
- Novelties and structural changes in a dynamical model of innovation processes
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Ansaloni, Luca; D., Bagatti; Lane, David Avra; Serra, Roberto

abstract

**2007**
- SURFACE REACTION MODELS OF PROTOCELLS
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; T., Carletti; I., Poli

abstract

**2007**
- Synchronization phenomena in protocell models
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto; Carletti, T.; Poli, I.; Villani, Marco

abstract

**2007**
- Synchronization phenomena in surface reaction models of protocells
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; T., Carletti; I., Poli

abstract

**2007**
- The influence of the topology of regulatory networks on the distribution of avalanches in gene expression data.
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Graudenzi, Alex; Colacci, A.; Kauffamn, S. A.

abstract

**2007**
- Valanghe in reti booleane a topologia scale-free
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Graudenzi, A.; Colacci, A.

abstract

**2007**
- WHY COMPLEXITY, WHICH COMPLEXITY
[Capitolo/Saggio]

Serra, Roberto

abstract

**2007**
- Why a simple model of genetic regulatory networks describes the distribution of avalanches in gene expression data
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Graudenzi, Alex; S. A., Kauffman

abstract

**2006**
- A NEW MODEL FOR POLLUTED SOIL RISK ASSESSMENT
[Articolo su rivista]

M., Andretta; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2006**
- A cDNA-microarray analysis of camptothecin resistance in glioblastoma cell lines
[Articolo su rivista]

Morandi, E; Zingaretti, C; Chiozzotto, D; Severini, C; Semeria, A; Horn, W; Vaccari, M; Serra, Roberto; Silingardi, P; Colacci, A.

abstract

**2006**
- ARTIFICIAL INTELLIGENCE: 50TH ANNIVERSARY 1956-2006
[Curatela]

L., Carlucci Aiello; M., Gori; M., Schaerf; Serra, Roberto; O., Stock; P., Torasso

abstract

**2006**
- COMPLEX SYSTEMS
[Articolo su rivista]

S., Bandini; Serra, Roberto

abstract

**2006**
- Coupled random boolean network forming an artificial tissue
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Serra, Roberto; Ingrami, P; Kauffman, Sa

abstract

**2006**
- FRA BIOLOGIA E VITA ARTIFICIALE: MODELI DI RETI GENETICHE
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto

abstract

**2006**
- On the distribution of small avalanches in random boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Serra, Roberto; Graudenzi, Alex; Kauffman, S. A.

abstract

**2005**
- A theory based dynamical model of innovation processes
[Relazione in Atti di Convegno]

Lane, David Avra; Serra, Roberto; Villani, Marco; Ansaloni, Luca

abstract

**2005**
- A theory based dynamical model of innovation processes
[Relazione in Atti di Convegno]

Lane, David Avra; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2005**
- RECENT RESULTS ON RANDOM BOOLEAN NETWORKS
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2004**
- A small-world network where all nodes have the same connectivity, with application to the dynamics of boolean interacting automata
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; L., Agostini

abstract

**2004**
- Genetic network models and statistical properties of gene expression data in knock-out experiments
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; A., Semeria

abstract

**2004**
- ON THE DYNAMICS OF RANDOM BOOLEAN NETWORKS WITH SCALE-FREE OUTGOING CONNECTIONS
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; L., Agostini

abstract

**2004**
- On the dynamics of scale-free boolean networks
[Capitolo/Saggio]

Serra, Roberto; Villani, Marco; L., Agostini

abstract

**2004**
- Perturbation in genetic regulatory networks: simulation and experiments
[Capitolo/Saggio]

Serra, Roberto; Villani, Marco; A., Semeria; S. A., Kauffman

abstract

**2003**
- DESCRIBING IN-VITRO CELL PROLIFERATION AND TRANSFORMATION WITH CELLULAR AUTOMATA
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2003**
- ROBUSTNESS TO DAMAGE OF BIOLOGICAL AND SYNTHETIC NETWORKS
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco; A., Semeria

abstract

**2002**
- PERTURBING THE REGULAR TOPOLOGY OF CELLULAR AUTOMATA: IMPLICATIONS FOR THE DYNAMICS
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2001**
- Bioremediation modelling: from the pilot plant to the field
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; M., Padovani; M., Andretta; Serra, Roberto; B., Muller; H. P., Ratzke; R., Rongo; W., Spataro; S., Di Gregorio

abstract

**2001**
- CELLULAR AUTOMATA AND COMPLEX SYSTEMS SIMULATION: SOME CASE STUDIES
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto

abstract

**2001**
- Cellular automata: from a theoretical computational model to its application to complex systems
[Articolo su rivista]

Bandini, S.; Mauri, G.; Serra, Roberto

abstract

**2001**
- Continuous genetic networks
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; A., Salvemini

abstract

**2001**
- Differential equations and cellular automata models of the growth of cell cultures and transformation foci
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; A., Colacci

abstract

**2001**
- MODELLING THE BIRTH OF TRANSFORMATION FOCI IN CELL CULTURES
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; A., Colacci

abstract

**2001**
- PARALLEL COMPUTING: SPECIAL ISSUE ON CELLULAR AUTOMATA
[Curatela]

S., Bandini; G., Mauri; Serra, Roberto

abstract

**2001**
- PREFACE TO THE SECTION "MODELS OF THE MIND"
[Prefazione o Postfazione]

Serra, Roberto

abstract

**2001**
- THE EMERGENCE OF THE MIND
[Curatela]

S., Colonna; Serra, Roberto; S., Carra'; M., Di Francesco; D., Parisi

abstract

**2000**
- A cellular automata model for the simulation of in vitro carcinogenesis tests
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco; A., Colacci

abstract

**2000**
- A new dynamical model of biodegradation
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; M., Mazzanti; M., Padovani; M., Andretta; Serra, Roberto; S., Di Gregorio; R., Rongo; W., Spataro

abstract

**2000**
- Cellular automata model for parallel simulation of contamination processes by oil in porous soils
[Relazione in Atti di Convegno]

M., Andretta; M. A., Mazzanti; Serra, Roberto; Villani, Marco; S., Di Gregorio; R., Rongo; W., Spataro

abstract

**2000**
- NEURAL NETWORKS FOR SULPHUR DIOXIDE GROUND LEVEL FORECASTING
[Articolo su rivista]

M., Andretta; A., Eleuteri; F., Fortezza; F., Manco; L., Mingozzi; Serra, Roberto; R., Tagliaferri

abstract

**2000**
- THE SCIENCE OF COMPLEX SYSTEMS
[Prefazione o Postfazione]

Serra, Roberto

abstract

**1999**
- An empirical method for modelling and simulating some complex macroscopic phenomena by cellular automata
[Articolo su rivista]

DI GREGORIO, S.; Serra, Roberto

abstract

**1999**
- Applying cellular automata to complex environmental problems: the simulation of the bioremediation of contaminated soils
[Articolo su rivista]

S., DI GREGORIO; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**1999**
- Biorisanamento in-situ di terreni contaminati
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Mazzanti, M.; Villani, Marco; Andretta, M.; Di Gregorio, S.; Rongo, R.; Spataro, W.

abstract

**1999**
- Colombo: a new model for the simulation of soil remediation
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; M., Andretta; M., Mazzanti; Villani, Marco; S., Di Gregorio

abstract

**1999**
- NUOVI MODELLI DI RETI GENETICHE
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto

abstract

**1999**
- Progetto Colombo: realizzazione di impianti pilota per la taratura e la verifica sperimentale del modello
[Relazione in Atti di Convegno]

Andretta, M.; Campisi, T.; Mingozzi, L.; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**1999**
- Progetto Colombo: un nuovo modello di simulazione di fenomeni di biorisanamento In-situ
[Relazione in Atti di Convegno]

Andretta, M.; Mazzanti, M.; Villani, Marco; Serra, Roberto; Di Gregorio, S.

abstract

**1998**
- BIOTECHNOLOGY FOR SOIL REMEDIATION
[Curatela]

Serra, Roberto

abstract

**1998**
- Bioremediation simulation models
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Di Gregorio, S.; Villani, Marco; Andretta, M.

abstract

**1998**
- CELLULAR AUTOMATA. RESEARCH TOWARDS INDUSTRY
[Curatela]

S., Bandini; Serra, Roberto; F., Suggi Liverani

abstract

**1998**
- Environmental applications of genetic algorithms
[Relazione in Atti di Convegno]

Di Gregorio, S.; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**1998**
- Genetic network models of biodegradation
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Salvemini, A.

abstract

**1998**
- MODELLING THE INTERACTION OF PHYSICAL, CHEMICAL AND BIOLOGICAL PHENOMENA IN POROUS SOILS: A SUMMARY OF RESULTS
[Articolo su rivista]

S., DI GREGORIO; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**1998**
- Recent advances in dynamical models of bioremediation
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Oricchio, D.; Di Gregorio, S.

abstract

**1997**
- A CELLULAR AUTOMATA MODEL OF SOIL BIOREMEDIATION
[Articolo su rivista]

S., DI GREGORIO; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**1997**
- MODELLING BACTERIAL DEGRADATION OF ORGANIC COMPOUNDS WITH GENETIC NETWORKS
[Articolo su rivista]

SERRA, Roberto; VILLANI, Marco

abstract

**1996**
- Combining cellular automata and genetic search in complex environmental modelling
[Relazione in Atti di Convegno]

Di Gregorio, S.; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**1996**
- Mathematical models for bioremediation of contaminated soils
[Relazione in Atti di Convegno]

Andretta, M.; Di Gegorio, S.; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**1996**
- Parallel simulation of soil contamination by cellular automata
[Relazione in Atti di Convegno]

Di Gregorio, S.; Rongo, R.; Serra, Roberto; Spataro, W.; Spezzano, G.; Talia, D.; Villani, Marco

abstract

**1996**
- Simulation of water flow through a porous soil by a Cellular Automaton model
[Relazione in Atti di Convegno]

Di Gregorio, S.; Rongo, R.; Serra, Roberto; Spataro, W.; Villani, Marco

abstract

**1994**
- SISTEMI COMPLESSI E PROCESSI COGNITIVI
[Monografia/Trattato scientifico]

Serra, Roberto; G., Zanarini

abstract

**1993**
- Machine learning and organizational learning processes
[Articolo su rivista]

Warglien, M.; Serra, Roberto

abstract

**1990**
- Complex systems and cognitive processes
[Monografia/Trattato scientifico]

Serra, Roberto; G., Zanarini

abstract

**1990**
- LEARNING AND BUCKET BRIGADE DYNAMICS IN CLASSIFIER SYSTEMS
[Articolo su rivista]

M., Compiani; D., Montanari; Serra, Roberto

abstract

**1988**
- COMPLEXITY IN NATURAL AND CULTURAL SYSTEMS
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; G., Zanarini

abstract

**1988**
- COOPERATIVE PHENOMENA IN ARTIFICIAL INTELLIGENCE
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; G., Zanarini; F., Fasano

abstract

**1986**
- ADIABATIC ELIMINATION OF FAST RELAXING VARIABLES IN SOCIO-ECONOMIC DYNAMICAL MODELS
[Articolo su rivista]

H., Sedehi; Serra, Roberto; S., Vassallo

abstract

**1986**
- INTRODUCTION TO THE PHYSICS OF COMPLEX SYSTEMS
[Monografia/Trattato scientifico]

Serra, Roberto; G., Zanarini; M., Andretta; M., Compiani

abstract

**1986**
- LA FISICA DEI SISTEMI COMPLESSI
[Articolo su rivista]

M., Compiani; Serra, Roberto

abstract

**1986**
- TRA ORDINE E CAOS
[Monografia/Trattato scientifico]

Serra, Roberto; G., Zanarini

abstract

**1985**
- NONEQUILIBRIUM STATISTICAL THERMODYNAMICS IN THE LIMIT OF LARGE RESISTANCE
[Articolo su rivista]

B. H., Lavenda; Serra, Roberto

abstract

**1985**
- THEORY OF ACTIVATED REACTION PROCESSES: NONLINEAR COUPLING BETWEEN REACTIVE AND NON REACTIVE MODES
[Articolo su rivista]

M., Compiani; T., Fonseca; P., Grigolini; Serra, Roberto

abstract

**1985**
- TRANSPORT PROPERTIES AND SOLITON MODELS OF POLYACETYLENE
[Capitolo/Saggio]

M., Andretta; Serra, Roberto; G., Zanarini; K., Pendergast

abstract

**1984**
- INTRODUZIONE ALLA FISICA DEI SISTEMI COMPLESSI
[Monografia/Trattato scientifico]

Serra, Roberto; G., Zanarini; M., Andretta; M., Compiani

abstract

**1984**
- SOLITONI E POLARONI IN POLIMERI ELETTRICAMENTE ATTIVI
[Articolo su rivista]

M., Andretta; Serra, Roberto; G., Zanarini

abstract

**1984**
- STOCHASTIC INTEGRALS INDUCED BY TIME SCALE CHANGES
[Articolo su rivista]

B. H., Lavenda; Serra, Roberto

abstract

**1979**
- A COMMENT ON PROTON ELECTRIC POLARIZABILITY
[Articolo su rivista]

P., Mazzanti; Serra, Roberto; F., Cannata

abstract