Marco VILLANI Professore Associato presso: Dipartimento di Scienze Fisiche, Informatiche e Matematiche sede ex-Fisica |

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## Pubblicazioni

**2018**
- A comparison between threshold ergodic sets and stochastic simulation of boolean networks for modelling cell differentiation
[Relazione in Atti di Convegno]

Braccini, Michele; Roli, Andrea; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2018**
- A relevance index method to infer global properties of biological networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Sani, Laura; Amoretti, Michele; Vicari, Emilio; Pecori, Riccardo; Mordonini, Monica; Cagnoni, Stefano; Serra, Roberto

abstract

**2018**
- An iterative information-theoretic approach to the detection of structures in complex systems
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; Sani, Laura; Pecori, Riccardo; Amoretti, Michele; Roli, Andrea; Mordonini, Monica; Serra, Roberto; Cagnoni, Stefano

abstract

**2018**
- Dynamical Criticality in Gene Regulatory Networks
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; La Rocca, Luca; Kauffman, Stuart Alan; Serra, Roberto

abstract

**2018**
- Dynamical properties of a gene-protein model
[Relazione in Atti di Convegno]

Sapienza, Davide; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2018**
- Simulating populations of protocells with uneven division
[Relazione in Atti di Convegno]

Musa, Martina; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Automatic design of boolean networks for cell differentiation
[Relazione in Atti di Convegno]

Braccini, Michele; Roli, Andrea; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Dynamical criticality: overview and open questions
[Articolo su rivista]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Dynamical regimes in non-ergodic random Boolean networks
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; Campioli, Davide; Damiani, Chiara; Roli, Andrea; Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- GPU-based parallel search of relevant variable sets in complex systems
[Relazione in Atti di Convegno]

Vicari, Emilio; Amoretti, Michele; Sani, Laura; Mordonini, Monica; Pecori, Riccardo; Roli, Andrea; Villani, Marco; Cagnoni, Stefano; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Identifying Critical States through the Relevance Index
[Articolo su rivista]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Caprari, Riccardo; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Locating critical regions by the Relevance Index
[Relazione in Atti di Convegno]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- Modelling Protocells
[Monografia/Trattato scientifico]

Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2017**
- New paths for the application of DCI in social sciences: Theoretical issues regarding an empirical analysis
[Relazione in Atti di Convegno]

Righi, Riccardo; Roli, Andrea; Russo, Margherita; Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2017**
- Synchronization in near-membrane reaction models of protocells
[Relazione in Atti di Convegno]

Calvanese, Giordano; Villani, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2017**
- The use of omics-based approaches in regulatory toxicology: An alternative approach to assess the no observed transcriptional effect level
[Articolo su rivista]

Quercioli, Daniele; Roli, Andrea; Morandi, Elena; Perdichizzi, Stefania; Polacchini, Laura; Rotondo, Francesca; Vaccari, Monica; Villani, Marco; Serra, Roberto; Colacci, Annamaria

abstract

**2016**
- Beyond Networks: Search for Relevant Subsets in Complex Systems
[Capitolo/Saggio]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto

abstract

**2016**
- Dynamically critical systems and power-law distributions: Avalanches revisited
[Capitolo/Saggio]

Di Stefano, Marina L.; Villani, Marco; LA ROCCA, Luca; Kauffman, Stuart A.; Serra, Roberto

abstract

**2016**
- Efficient search of relevant structures in complex systems
[Relazione in Atti di Convegno]

Sani, Laura; Amoretti, Michele; Vicari, Emilio; Mordonini, Monica; Pecori, Riccardo; Roli, Andrea; Villani, Marco; Cagnoni, Stefano; Serra, Roberto

abstract

**2016**
- On the dynamics of autocatalytic cycles in protocell models
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Filisetti, Alessandro; Nadini, Matthieu; Serra, Roberto

abstract

**2016**
- On the robustness of the detection of relevant sets in complex dynamical systems
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani, Marco; Carra, Pietro; Roli, Andrea; Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto

abstract

**2015**
- Dynamical Properties of Artificially Evolved Boolean Network Robots
[Relazione in Atti di Convegno]

Roli, Andrea; Villani, Marco; Serra, Roberto; Benedettini, Stefano; Pinciroli, Carlo; Birattari, Mauro

abstract

**2015**
- Exploring the organisation of complex systems through the dynamical interactions among their relevant subsets
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti, Alessandro; Villani, Marco; Roli, Andrea; Fiorucci, Marco; Serra, Roberto

abstract

**2015**
- The Search for Candidate Relevant Subsets of Variables in Complex Systems
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; Roli, Andrea; Filisetti, Alessandro; Fiorucci, Marco; Serra, Roberto; Poli, Irene

abstract

**2014**
- A stochastic model of catalytic reaction networks in protocells
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Filisetti, Alessandro; Villani, Marco; Graudenzi, Alex; Damiani, Chiara; Panini, Tommaso

abstract

**2014**
- Attractors Perturbations in Biological Modelling: Avalanches and Cellular Differentiation
[Capitolo/Saggio]

Marco Villani; Roberto Serra

abstract

**2014**
- Automatic Design of Boolean Networks for Modelling Cell Differentiation
[Capitolo/Saggio]

Stefano Benedettini;
Andrea Roli;
Roberto Serra;
Marco Villani

abstract

**2014**
- Evolution, Complexity and Artificial Life
[Curatela]

Stefano Cagnoni; Marco Mirolli; Marco Villani

abstract

**2014**
- Growth and division in a dynamic protocell model
[Articolo su rivista]

Villani, Marco; Filisetti, Alessandro; Graudenzi, Alex; Damiani, Chiara; Carletti, Timoteo; Serra, Roberto

abstract

**2014**
- Identifying emergent dynamical structures in network models
[Relazione in Atti di Convegno]

Marco Villani;
Stefano Benedettini;
Andrea Roli;
David Lane;
Irene Poli;
Roberto Serra

abstract

**2014**
- Investigating the Role of Network Topology and Dynamical Regimes on the Dynamics of a Cell Differentiation Model
[Capitolo/Saggio]

Graudenzi, Alex; Damiani, Chiara; Paroni, Andrea; Filisetti, Alessandro; Villani, Marco; Serra, Roberto; Antoniotti, Marco

abstract

**2014**
- Le reti intorno a noi
[Articolo su rivista]

Villani, Marco

abstract

**2014**
- On RAF Sets and Autocatalytic Cycles in Random Reaction Networks
[Capitolo/Saggio]

Filisetti, Alessandro; Villani, Marco; Damiani, Chiara; Graudenzi, Alex; Roli, Andrea; Hordijk, Wim; Serra, Roberto

abstract

**2014**
- On Some Properties of Information Theoretical Measures for the Study of Complex Systems
[Capitolo/Saggio]

Filisetti, Alessandro; Villani, Marco; Roli, Andrea; Fiorucci, Marco; Poli, Irene; Serra, Roberto

abstract

**2013**
- A model of protocell based on the introduction of a semi-permeable membrane in a stochastic model of catalytic reaction networks
[Abstract in Rivista]

Roberto Serra; Alessandro Filisetti; Alex Graudenzi; Chiara Damiani; Marco Villani

abstract

**2013**
- Dynamical regimes and learning properties of evolved Boolean networks
[Articolo su rivista]

Stefano Benedettini; Marco Villani; Andrea Roli; Roberto Serra;Mattia Manfroni; Antonio Gagliardi; Carlo Pinciroli; Mauro Birattari

abstract

**2013**
- Emergent properties of gene regulatory networks - models and data
[Capitolo/Saggio]

Roberto Serra;
Marco Villani

abstract

**2013**
- Exaptation in innovation processes: theory and models
[Capitolo/Saggio]

G. Bonifati; M. Villani

abstract

**2013**
- Identification of Dynamical Structures in Artificial Brains: An Analysis of Boolean Network Controlled Robots
[Relazione in Atti di Convegno]

Andrea Roli;
Marco Villani;
Roberto Serra;
Lorenzo Garattoni;
Carlo Pinciroli;
Mauro Birattari

abstract

**2013**
- Mechanism for the formation of density gradients through semipermeable membranes
[Articolo su rivista]

Roberto Serra; Marco Villani

abstract

**2013**
- On the dynamical properties of a model of cell differentiation
[Articolo su rivista]

Marco Villani; Roberto Serra

abstract

**2013**
- Recent developments in research on catalytic reaction networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Chiara Damiani; Alessandro Filisetti; Alex Graudenzi; Marco Villani; Roberto Serra

abstract

**2013**
- The detection of intermediate-level emergent structures and patterns
[Relazione in Atti di Convegno]

M. Villani; A. Filisetti; S. Benedettini; A. Roli; D. Lane; R. Serra

abstract

**2013**
- The role of backward reactions in a stochastic model of catalytic reaction networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Alessandro Filisetti; Alex Graudenzi; Chiara Damiani; Marco Villani; Roberto Serra

abstract

**2012**
- Noise-Induced Emergent Hierarchies in a CA Model
[Relazione in Atti di Convegno]

Marco Villani; Roberto Serra; Stefano Benedettini; Andrea Roli; David Lane

abstract

**2012**
- WIVACE 2012 - Workshop Italiano di Vita Artificiale e Computazione Evolutiva
[Esposizione]

Stefano Cagnoni; Marco Mirolli; Marco Villani

abstract

**2011**
- A Dynamical Model of Cell Differentiation
[Relazione in Atti di Convegno]

M. Villani; A. Barbieri; R. Serra

abstract

**2011**
- A dynamical model of genetic networks for cell differentiation
[Articolo su rivista]

M. Villani; A. Barbieri; R. Serra

abstract

**2011**
- A stochastic model of autocatalytic reaction networks
[Articolo su rivista]

Alessandro Filisetti; Alex Graudenzi; Roberto Serra; Marco Villani; Rudolf M. Füchslin; Norman Packard; Stuart A. Kauffman; Irene Poli

abstract

**2011**
- A stochastic model of the emergence of autocatalytic cycles
[Articolo su rivista]

Alessandro Filisetti; Alex Graudenzi; Roberto Serra; Marco Villani; Davide De Lucrezia; Rudolf M Füchslin; Stuart A Kauffman; Norman Packard; Irene Poli

abstract

**2011**
- Analysis of attractor distances in random boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Roli A.; Benedettini S.; Serra R.; Villani M.

abstract

**2011**
- Cell differentiation in noisy random boolean networks.
[Relazione in Atti di Convegno]

Barbieri A.; Villani M.; Serra R.; Kauffman S.A.; Colacci

abstract

**2011**
- Cell-cell interaction and diversity of emergent behaviours
[Articolo su rivista]

C. Damiani; R. Serra; M. Villani; S.A. Kauffman; A. Colacci

abstract

**2011**
- Conditions for long lasting sustainable innovation in an agent-based model
[Relazione in Atti di Convegno]

Ansaloni L.; Villani M.; Serra R.; Lane D.A.

abstract

**2011**
- Dynamical properties of a Boolean model of gene regulatory network with memory
[Articolo su rivista]

Graudenzi G.; Serra R.; Villani M.; Damiani C.; Colacci A.; Kauffman S.A.

abstract

**2011**
- Dynamical stability in random Boolean Networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Davide CAMPIOLI; Marco VILLANI; Irene POLI; Roberto SERRA

abstract

**2011**
- Robustness analysis of a model of gene regulatory network with memory
[Articolo su rivista]

A. Graudenzi; R. Serra; M. Villani; C. Damiani; A. Colacci; S.A. Kauffman

abstract

**2011**
- Stochastic Local Search to Automatically Design Boolean Networks with Maximally Distant Attractors
[Relazione in Atti di Convegno]

Stefano Benedettini;
Andrea Roli;
Roberto Serra;
Marco Villani

abstract

**2011**
- The influence of the residence time on the dynamics of catalytic reaction networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti A.; Serra R.; Villani M.; Graudenzi A.; Fuechslin R.; Poli I.

abstract

**2011**
- The role of energy in a stochastic model of the emergence of autocatalytic sets
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti A.; Graudenzi A.; Serra R.; Villani M.; De Lucrezia D.; Poli I.

abstract

**2010**
- A stochastic model of catalytic reaction networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti A.; Serra R.; Villani M.; Fuechslin R.; Packard N.; Kauffman S.A.; Poli I.

abstract

**2010**
- A theory-based dinamical model of exaptive innovation processes
[Capitolo/Saggio]

Villani M.; Ansaloni L.

abstract

**2010**
- Dynamical stability of autocatalytic sets
[Relazione in Atti di Convegno]

Fuechslin R.; Filisetti A.; Serra R.; Villani M.; De Lucrezia D.; Poli I.

abstract

**2010**
- Information transfer among coupled Random Boolean Networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Chiara, Damiani; Kauffman, Stuart A.; Serra, Roberto; Villani, Marco; Annamaria, Colacci

abstract

**2010**
- Noisy random boolean networks and cell differentiation
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani M.; Serra R.; Barbieri A.; Roli A.; Kauffman S.A.; Colacci A.

abstract

**2010**
- Non-linear protocell models: synchronization and chaos
[Articolo su rivista]

Filisetti, Alessandro; Serra, Roberto; Carletti, T.; Villani, Marco; Poli, I.

abstract

**2010**
- On the dynamics of random Boolean networks subject to noise: attractors, ergodic sets and cell types
[Articolo su rivista]

Serra, Roberto; Villani, Marco; Barbieri, Alessia; Kauffman, S. A.; Colacci, A.

abstract

**2010**
- WIRN 2010 - SPECIAL SESSION on THE DYNAMICS OF BIOLOGICAL NETWORKS
[Esposizione]

Marco Villani; Roberto Serra; Carlo Morabito

abstract

**2009**
- Distributed processes in an agent-based model of innovation
[Relazione in Atti di Convegno]

Ansaloni L.; Villani M.; Lane D

abstract

**2009**
- Dynamical critical systems for information processing: a preliminary study
[Relazione in Atti di Convegno]

L.Ansaloni; M.Villani; R.Serra

abstract

**2009**
- Dynamics of Interconnected Boolean Networks with scale-free topology
[Relazione in Atti di Convegno]

Damiani C.; Villani M.; Darabos C.; Tomassini M.

abstract

**2009**
- Exaptive processes: an agent-based model
[Capitolo/Saggio]

Villani Marco; Bonacini Stefano; Ferrari Davide; Serra Roberto

abstract

**2009**
- Extended notion of attractors in noisy random Boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

A.Barbieri; M.Villani; R.Serra; S.A.Kauffman; A.Colacci

abstract

**2009**
- Genetic regulatory networks and neural networks
[Relazione in Atti di Convegno]

R. Serra; A. Graudenzi; M. Villani

abstract

**2009**
- How critical random boolean networks may be affected by interaction with others
[Relazione in Atti di Convegno]

C.Damiani; A.Graudenzi; M.Villani

abstract

**2009**
- Investigating cell criticality
[Relazione in Atti di Convegno]

R. Serra; M. Villani; C. Damiani; A. Graudenzi; P. Ingrami; A. Colacci

abstract

**2009**
- L’influenza delle perturbazioni sul paesaggio degli attrattori di una rete booleana casuale
[Relazione in Atti di Convegno]

Barbieri A.; Villani M.; Serra R.

abstract

**2009**
- Modelling Innovation
[Capitolo/Saggio]

Serra Roberto; Villani Marco; Lane David

abstract

**2009**
- Non linear protocell models: Syncronisation and Chaos
[Relazione in Atti di Convegno]

A.Filisetti; R.Serra; T.Carletti; M.Villani; I.Poli

abstract

**2009**
- On the fate of perturbations in critical random Boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

C.Damiani; A.Graudenzi; M.Villani; R.Serra; A.Colacci; Stuart A. Kauffman

abstract

**2009**
- Quando un insieme di reazioni è autocatalitico
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti A.; Serra R.; Villani M.; Carletti T.; Füchslin R.M.; Poli I.

abstract

**2009**
- Separating internal and external fluctuation in distributed web-based services
[Relazione in Atti di Convegno]

S.Casolari; M.Villani; M.Colajanni; R.Serra

abstract

**2009**
- Studi preliminari per una rete booleana capace di apprendere da esempi
[Relazione in Atti di Convegno]

Ansaloni L.; Villani M.; Serra R.

abstract

**2009**
- Synchronization phenomena in non linear protocell model
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti A.; Serra R.; Carletti T.; Villani M.; Poli I.

abstract

**2009**
- The influence of noise on the dynamics of random boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

Barbieri, Alessia; Villani, Marco; Serra, Roberto; Kauffman, S. A.; Colacci, A.

abstract

**2009**
- Timing of molecular processes in a synchronous Boolean model of genetic regulatory network
[Relazione in Atti di Convegno]

A.Graudenzi; R.Serra; M.Villani; C.Damiani; A.Colacci; Stuart A. Kauffman

abstract

**2009**
- WORKSHOP on COMPLEXITY, EVOLUTION AND EMERGENT INTELLIGENCE
[Esposizione]

Marco Villani; Stefano Cagnoni

abstract

**2008**
- A CA MODEL OF SPONTANEOUS FORMATION OF CONCENTRATION GRADIENTS
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI

abstract

**2008**
- ARTIFICIAL LIFE AND EVOLUTIONARY COMPUTATION
[Curatela]

R. SERRA; M. VILLANI; I. POLI

abstract

**2008**
- COMUNICAZIONE CELLULARE, LIVELLI E STRUTTURE ORDINATE
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; C. DAMIANI; A. GRAUDENZI; A.COLACCI

abstract

**2008**
- Global and local processes in a model of innovation
[Capitolo/Saggio]

Villani M.; Serra R.; Ansaloni L.; Lane D.

abstract

**2008**
- SUFFICIENT CONDITIONS FOR EMERGENT SYNCHRONIZATION IN PROTOCELL MODELS
[Articolo su rivista]

T. CARLETTI; R.SERRA; I. POLI; M.VILLANI; A. FILISETTI

abstract

**2008**
- SYNCHRONIZATION PHENOMENA IN PROTOCELL MODELS
[Articolo su rivista]

A. FILISETTI; R. SERRA; T. CARLETTI; I. POLI; M. VILLANI

abstract

**2008**
- THE DIFFUSION OF PERTURBATIONS IN A MODEL OF COUPLED RANDOM BOOLEAN NETWORKS
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; C. DAMIANI; A. GRAUDENZI; A. COLACCI

abstract

**2008**
- THE SIMULATION OF GENE KNOCK-OUT IN SCALE-FREE RANDOM BOOLEAN MODELS OF GENETIC NETWORKS
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; A. GRAUDENZI; A. COLACCI; S.A. KAUFFMAN

abstract

**2007**
- An agent-based model of exaptive processes
[Articolo su rivista]

M. VILLANI; S. BONACINI; D. FERRARI; R. SERRA; D. LANE

abstract

**2007**
- Complexity course design
[Capitolo/Saggio]

MANCINELLI E; MORETTI M; M. VILLANI

abstract

**2007**
- Comunicazione cellulare, livelli e strutture ordinate.
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra R.; Villani M.; Damiani C.; Graudenzi A.; Colacci A.

abstract

**2007**
- Conditions for emergent synchronization in protocells.
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra R.; Carletti T.; Poli I.; Villani M.; Filisetti A

abstract

**2007**
- Educating managers in Complexity
[Curatela]

M. Villani

abstract

**2007**
- Interacting random boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

R. SERRA; M. VILLANI; C. DAMIANI ; A. GRAUDENZI ; A. COLACCI ; S.A. KAUFFAMN

abstract

**2007**
- Learning about complexity.
[Capitolo/Saggio]

MANCINELLI E; MORETTI M; M. VILLANI

abstract

**2007**
- Modelli di protocellule e sincronizzazione
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra R.; Carletti T.; Poli I.; Villani M.; Filisetti A

abstract

**2007**
- Networks and complex systems
[Capitolo/Saggio]

M. VILLANI

abstract

**2007**
- Novelties and structural changes in a dynamical model of innovation processes
[Relazione in Atti di Convegno]

M. VILLANI; L. ANSALONI; D. BAGATTI; D. LANE ; R. SERRA

abstract

**2007**
- Synchronization phenomena in protocell models
[Relazione in Atti di Convegno]

Filisetti A.; Serra R.; Carletti T.; Poli I.; Villani M.

abstract

**2007**
- The influence of the topology of regulatory networks on the distribution of avalanches in gene expression data.
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra R.; Villani M.; Graudenzi A.; Colacci A.; Kauffamn S.A.

abstract

**2007**
- The management of complexity, the complexity of management
[Esposizione]

M.Villani

abstract

**2007**
- Valanghe in reti booleane a topologia scale-free
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra R.; Villani M.; Graudenzi A.; Colacci A

abstract

**2007**
- Why a simple model of genetic regulatory networks describes the distribution of avalanches in gene expression data
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; A. GRAUDENZI; S.A. KAUFFMAN

abstract

**2006**
- A NEW MODEL FOR POLLUTED SOIL RISK ASSESSMENT
[Articolo su rivista]

M. ANDRETTA; R. SERRA; M. VILLANI

abstract

**2006**
- Agents, equations and all that: on the role of agents in understanding complex systems
[Capitolo/Saggio]

SERRA R; M. VILLANI

abstract

**2006**
- Coupled random boolean network forming an artificial tissue
[Relazione in Atti di Convegno]

Villani M; Serra R; Ingrami P; Kauffman SA

abstract

**2006**
- On the distribution of small avalanches in random boolean networks
[Relazione in Atti di Convegno]

M. VILLANI; SERRA; R; GRAUDENZI, A.; KAUFFMAN; S.A

abstract

**2005**
- A theory based dynamical model of innovation processes
[Relazione in Atti di Convegno]

LANE D; SERRA R; M. VILLANI

abstract

**2005**
- A theory based dynamical model of innovation processes
[Articolo su rivista]

D. LANE; R. SERRA; M. VILLANI; L. ANSALONI

abstract

**2005**
- MITICA
[Partecipazione a progetti di ricerca]

M. Villani; R. Serra;

abstract

**2005**
- RECENT RESULTS ON RANDOM BOOLEAN NETWORKS
[Relazione in Atti di Convegno]

R. SERRA; M. VILLANI

abstract

**2004**
- A small-world network where all nodes have the same connectivity, with application to the dynamics of boolean interacting automata
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; L. AGOSTINI

abstract

**2004**
- CETRA
[Partecipazione a progetti di ricerca]

M. Villani; R. Serra; D. Lane; A. Ginzburg

abstract

**2004**
- Genetic network models and statistical properties of gene expression data in knock-out experiments
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; A. SEMERIA

abstract

**2004**
- ON THE DYNAMICS OF RANDOM BOOLEAN NETWORKS WITH SCALE-FREE OUTGOING CONNECTIONS
[Articolo su rivista]

R.SERRA; M. VILLANI; L. AGOSTINI

abstract

**2004**
- On the dynamics of scale-free boolean networks
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; L. AGOSTINI

abstract

**2004**
- Perturbation in genetic regulatory networks: simulation and experiments
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; A. SEMERIA; S.A. KAUFFMAN

abstract

**2003**
- DESCRIBING IN-VITRO CELL PROLIFERATION AND TRANSFORMATION WITH CELLULAR AUTOMATA
[Capitolo/Saggio]

R. SERRA; M. VILLANI

abstract

**2003**
- ROBUSTNESS TO DAMAGE OF BIOLOGICAL AND SYNTHETIC NETWORKS
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; A. SEMERIA

abstract

**2002**
- ISCOM - The Information Society as a ComplexSystem
[Partecipazione a progetti di ricerca]

M. Villani; D. A. Lane; R. Serra; A. Ginzburg

abstract

**2002**
- PERTURBING THE REGULAR TOPOLOGY OF CELLULAR AUTOMATA: IMPLICATIONS FOR THE DYNAMICS
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra, Roberto; Villani, Marco

abstract

**2001**
- Bioremediation modelling: from the pilot plant to the field
[Relazione in Atti di Convegno]

M.Villani; M.Padovani; M.Andretta; R.Serra; B.Muller; H.P.Ratzke; R. Rongo; W.Spataro; S. Di Gregorio;

abstract

**2001**
- Continuous genetic networks
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; A. SALVEMINI.

abstract

**2001**
- Differential equations and cellular automata models of the growth of cell cultures and transformation foci
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; A. COLACCI

abstract

**2001**
- MODELLING THE BIRTH OF TRANSFORMATION FOCI IN CELL CULTURES
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI; A. COLACCI

abstract

**2000**
- A cellular automata model for the simulation of in vitro carcinogenesis tests
[Relazione in Atti di Convegno]

R.Serra; M.Villani; A.Colacci;

abstract

**2000**
- A new dynamical model of biodegradation
[Relazione in Atti di Convegno]

M. Villani; M.Mazzanti; M.Padovani; M.Andretta; R. Serra; S.Di Gregorio; R.Rongo; W.Spataro;

abstract

**2000**
- Cellular automata model for parallel simulation of contamination processes by oil in porous soils
[Relazione in Atti di Convegno]

M.Andretta; M.A.Mazzanti; R.Serra; M.Villani; S. Di Gregorio; R.Rongo; W.Spataro

abstract

**1999**
- Applying cellular automata to complex environmental problems: the simulation of the bioremediation of contaminated soils
[Articolo su rivista]

S. DI GREGORIO; R. SERRA; M. VILLANI

abstract

**1999**
- Biorisanamento in-situ di terreni contaminati
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra R.; Mazzanti M.; Villani M.; Andretta M.; Di Gregorio S.; Rongo R.; Spataro W.

abstract

**1999**
- Colombo: a new model for the simulation of soil remediation
[Relazione in Atti di Convegno]

R.Serra; M.Andretta; M.Mazzanti; M.Villani; S.Di Gregorio;

abstract

**1999**
- Progetto Colombo: realizzazione di impianti pilota per la taratura e la verifica sperimentale del modello
[Relazione in Atti di Convegno]

Andretta M.; Campisi T.; Mingozzi L.; Villani M.; Serra R.

abstract

**1999**
- Progetto Colombo: un nuovo modello di simulazione di fenomeni di biorisanamento In-situ
[Relazione in Atti di Convegno]

Andretta M.; Mazzanti M.; Villani M.; Serra R.; Di Gregorio S

abstract

**1998**
- Bioremediation simulation models
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra R.; Di Gregorio S.; Villani M; Andretta M.

abstract

**1998**
- COLOMBO - Parallel COmputers improve cLean up of sOils by Modelling BiOremediation
[Partecipazione a progetti di ricerca]

M. Villani; R. Serra;

abstract

**1998**
- Environmental applications of genetic algorithms
[Relazione in Atti di Convegno]

Di Gregorio S.; Serra R.; Villani M

abstract

**1998**
- Genetic network models of biodegradation
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra R.; Villani M.; Salvemini A.

abstract

**1998**
- MODELLING THE INTERACTION OF PHYSICAL, CHEMICAL AND BIOLOGICAL PHENOMENA IN POROUS SOILS: A SUMMARY OF RESULTS
[Articolo su rivista]

S. DI GREGORIO; R. SERRA; M. VILLANI

abstract

**1998**
- Recent advances in dynamical models of bioremediation
[Relazione in Atti di Convegno]

Serra R.; Villani M.; Oricchio D.; Di Gregorio S.

abstract

**1997**
- A CELLULAR AUTOMATA MODEL OF SOIL BIOREMEDIATION
[Articolo su rivista]

S. DI GREGORIO; R. SERRA; M.VILLANI

abstract

**1997**
- MODELLING BACTERIAL DEGRADATION OF ORGANIC COMPOUNDS WITH GENETIC NETWORKS
[Articolo su rivista]

R. SERRA; M. VILLANI

abstract

**1996**
- Combining cellular automata and genetic search in complex environmental modelling
[Relazione in Atti di Convegno]

Di Gregorio S.; Serra R.; Villani M.

abstract

**1996**
- Mathematical models for bioremediation of contaminated soils
[Relazione in Atti di Convegno]

Andretta M.; Di Gegorio S.; Serra R.; Villani M.

abstract

**1996**
- Parallel simulation of soil contamination by cellular automata
[Relazione in Atti di Convegno]

Di Gregorio S.; Rongo R.; Serra R.; Spataro W.; Spezzano G.; Talia D.; Villani M.

abstract

**1996**
- Simulation of water flow through a porous soil by a Cellular Automaton model
[Relazione in Atti di Convegno]

Di Gregorio S.; Rongo R.; Serra R.; Spataro W.; Villani M

abstract

**1995**
- Cellular Automata for the Bioremoval of TOxic Contaminants
[Partecipazione a progetti di ricerca]

M. Villani; R.Serra

abstract

**1995**
- LGANN: a parallel system combining a local genetic algorithm and neural networks for the prediction of secondary structure of proteins
[Articolo su rivista]

F.VIVARELLI; G.GIUSTI; M. VILLANI; R.CAMPANINI; P.FARISELLI; M.COMPIANI; R.CASADIO

abstract

**1994**
- Parallel Architectures and intrinsically Parallel Algorithms: Genetics Algorithms
[Articolo su rivista]

R.CAMPANINI; G. DI CARO; M. VILLANI; I. D'ANTONE; G.GIUSTI

abstract